Ordinary Anne Boonchuy, 13, finds a music box that sends her to Amphibia, a world full of frogs, toads, and giant insects. With help from Sprig, she must adjust to life in Amphibia and discover the first true friendship …

　　時は現代。神主の娘である神維那己は、幼馴染で友人の皇うるかとともに神社の倉庫から続く隠し地下通路を偶然発見する。そして、そこで迷っているうちに、偶然鋼鉄天使くるみ2式を発見し、起動させてしまう。くるみ2式は改良型の鋼鉄…