四个来自不同地方的小朋友小笛、小玥、小鑫、大龙为了学习武术，在嵩山相遇并成了好朋友。他们的武术教练潘勇保管着神珠“玥”，这是一颗拥有神力的宝物，善良的人得到它就能造福天下，而邪恶之人得到它却能为害四方。

枪神记讲述了基因锁作为一项神秘降临的超时代科技，它能促使人体机能在速度、力量、感官等得到空前强化。成功打开基因锁的人成为新时代的“特工”，而特工中的佼佼者们被称为——“枪神”。围绕基因锁这一新型军备，各势力激烈斗争，纷纷…