击败终极歼灭者后，海阳博士为帮助众人返回现世空间而启动聚核基因石，却不慎引起能量爆炸。爆炸的基因石碎片进入了不同的空间缝隙，引起空间缝隙能量失衡，导致大量时空异常现象出现。为避免时空交错，引发空间混乱，海澄与变形联盟四位…

哈帝星总部作为宇宙和平的守卫者，得知宇宙盗贼团伙又有了新动作，他们偷盗文明，转化能量，似乎在策划一场惊天阴谋！盗贼团伙的恶行使许多星球文明消失甚至毁灭，如今他们的魔爪已经伸向地球，于是派遣了守卫小分队——V5战队来保卫地球…

宇宙罪犯（天才科学家）畸咕因为在其他星球犯下重罪被银行警备队逮捕。不料畸咕却从银河监狱逃了出来。为了重新逮捕畸咕，银河警备队队长青龙驶着核心空间站展开追捕，但是在和畸咕战斗过程中掉入畸咕陷阱，误打误撞来到了地球。在地球上…

变形联盟和海澄合力击败敌人，平溪市再次回归和平。然而时空能量异常波动情况却愈演愈烈，导致现实世界与平行宇宙发生交错产生了时空歧点，时空兽也随之出现。就在变形联盟忙于对付时空兽修复时空歧点时，茜卡与双子星汇合，策划了一系列…