高中二年级的春天，雨宫莲转学至东京的“秀尽学园”。以某个事件为契机觉醒为“PERSONA”使者的莲，与新认识的伙伴们一同组成“心之怪盗团”。把沾满邪恶欲望的大人们的“扭曲欲望”给偷走，让其改过自新。另一方面，在城市中陆续发生了…

本作描写了主人公与同伴们白天作为学生生活，夜晚则运用名为“Persona”的特殊力量，化身为“窃取心灵的怪盗”，向社会中扭曲腐坏的大人们发起挑战的都市浪漫物语。