在海边有一栋大宅邸，宝可梦们就在那里玩起了“捉迷藏”。决定好由皮卡丘当鬼后，大家都躲好了吗？这时候，幼基拉斯因为自己一个人很无聊，踢飞了一颗大石头。可是石头却击中了割草机，让割草机动了起来。割草机就追著皮卡丘们大暴走…

真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下…

故事发生于东京，在全球最大体育盛事WSG即将召开之际，知名企业的高官却接连在赞助商酒会现场遭到绑架，而自新名古屋站至东京的最高时速1000km的真空超导磁悬浮列车也被卷入其中，一场牵动国际目光的重大案件就此展开。

讲述灰原哀的过往。

　　小智（松本梨香 配音）一行人继续着磨练技艺的旅途，他们来到了欧鲁德朗城，这里正在举行为了纪念百年前阻止了战争的勇者亚朗而设置的对战祭典。小智带着皮卡丘（大谷育江 配音）勇敢参战，并且最终凭借着强大的实力夺得了头筹，获得…

　　高城一砂（关智一 配音）自幼丧母，被亲戚收养的他逐渐养成了内向收敛的性格。一砂有个名叫千砂（林原惠美 配音）的姐姐，但她身处何处安危与否一砂一概不知。一日，一砂感到躁动不安，跟随着内心的指引，一砂回到了曾经居住过的老宅…

　　被人类用基因技术克隆出来的最强宠物小精灵超梦（市村正亲 配音）带着对自我身份的疑惑和对人类强大的愤怒逃离了科研所，它宣布要对制造出自己的人类进行复仇。　　已经得到了八个勋章的小智（松本梨香 配音），以成为宠物小精灵训练…

旅にはいつも出会いと別れがある。