影片讲述男孩比利(劳瑟饰)被母亲送到父亲身边，并转了学校，但保守的新学校压制着他。比利不得不采取行动，挑战学校权威，以获得“返校节皇后”的称号。

一个年轻的男孩对他已故的祖母的人物着迷，并被送到一个孤立的寄宿学校，该学校由一位神秘的校长和他的妻子管理。

　　故事从传说中的夸克族与暗黑族开始延伸。善良与邪恶形成两势力对抗，加入「萌学园」里的萌骑士团结在一起保护结界。萌学园里的魔法预言书蕴藏著什麼天大的秘密？奈亚公主及忧伤艾瑞克纯纯的情愫正在发酵，误闯萌学园的坚尼，会为萌骑…

　　一天，月亮在这个学园变成了红色的，一切都变了，原本力量强大的海地司被熇炎带进反噬镜，破坏时空封印的部分结界，不慎开启被封印多年时空裂缝，窜出的闇黑气息连带影响日月潮汐，萌学园的生活都变了，夸克族会打败闇黑势力吗？

　　萌骑士团与阇黑大战之后的半年，陨石突然飞向萌学园，彗星小组却察觉萌骑士队长艾瑞克竟随着陨石掉落到萌学园！大甜甜教员立刻展开治疗驶卷使微弱的艾瑞克，并联络夸特诺基地的陶格长老帮忙。　　相同，谜亚星却掉落在地球上的夸特诺…

　　在这个世界中，江湖永远不死，江湖中出没的大侠们亦不会被人遗忘。珍贵的七星绝杀阵四部经书关系到世界的安危，亦令许多渴望统治世界的不轨之徒们垂涎三尺。为了守护这四部经书，先人成立了东城、西城、南城、北城四所学校，将经书交…

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