穆德（David Duchovny 大卫?杜楚尼 饰）被外星反叛者劫持，而斯科莉（Gillian Anderson 吉莲?安德森 饰）亦同时发现自己怀有身孕。穆德的办公室被搜查，斯科莉请求Skinner（Mitch Pileggi 饰）帮助寻找搭档，孤枪侠也参与进来。F…

在电影FTF里出现的变种alien从一个基因技术研究公司的员工肚子里钻出来逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他带Mulder去找那个alien。Scully证明出Gibson可能是外星人（所有人类都可能是）。X档案现在由Spender和Fowley…

美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一起离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今下落不明。从此穆德便专注于神秘事件的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，…

继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。…

X档案关闭后，穆德（David Duchovny 大卫?杜楚尼 饰）和斯科莉（Gillian Anderson 吉莲?安德森 饰）被分开。穆德受命执行监听工作，斯科莉则回到学院读书。 　　某日国会议员麦特森（Raymond J. Barry 饰）向穆德透露一条消息…

Mulder在医院被Fowley监管着。他想办法请来了Skinner和Kritschgau来帮忙，他们了解到Mulder拥有了CIA一直在研究的读心术。Scully在象牙海岸寻找治愈Mulder的办法。Mulder的病情加重了。

二次世界大战的冷战期间，古巴危机将美苏两大强国剑拔弩张，而发生在1968年5月的一起事件则无疑将危机推向一触即发的境地。刚刚结束漫长航行并原本准备退休的海军舰长迪米（艾德·哈里斯 Ed Harris 饰），被上司命令即刻做最后一次巡航，…

Audrey（哈莉·贝瑞饰）和丈夫Brian（大卫·杜楚尼饰）结婚11年，共同孕育了一对儿女，日子过的幸福平静。某天，Brian因为介入陌生家庭的纠纷而丧生，Audrey原本温顺的生活突然张开血盆大口，风云突变。为了填补空白，Audrey邀请丈…